真菌
真菌者，真核生物之類也。微至酵母菌，巨至菇蕈，皆屬其類。其以不動型類植物，以合肝醣類動物，不以花生殖是順故，嘗與藻類被稱隠花植物。一九六九年，洋人惠塔克氏（Whittaker）暢五界説，真菌由是獨立，是為「真菌界」。今分子系統析，菌類遠植物而近動物（後鞭毛生物）。真菌之屬，有染植物而致病疫者，有侵動物而致癬疾者，然多者並無其害，或成地衣以給養，或組菌根以輸通，其分解養分，以歸之於大地。微真菌，生態系其四分五裂矣。真菌亦為人所用，食品藥物，得益於真菌者眾。
類系
纂盤古之時，真菌者惟四門，壺、接合、子囊、擔子是矣。二零零七年英真菌學會云，真菌界有微孢子蟲門、壺菌門、新麗鞭毛菌門、芽枝霉門、捕蟲黴菌亞門、梳霉亞門、蟲黴菌亞門、毛黴菌亞門、球囊菌門、含子囊菌門、擔子菌門之雙核亞界。今者十載打過，分類遞嬗，二零一八年，真菌界十有八門矣。
天演
纂今分子系統析云，真菌近動物。云二者由類「領鞭毛蟲」（choanoflagellate）之祖先分岐。領鞭毛蟲者，單幺也，細胞在盃状物，後有一鞭。真菌原始之壺菌類與之同，有一鞭，證據是也。故總動物與真菌，名以後鞭毛類。
古來，卵菌與黏菌亦真菌之屬，然今之所知，其形類真菌，乃趨同所致，非真菌矣。今前者歸於SAR分類群，而後者歸之變形蟲界矣。